Demande d'installation Kmerator2

Bonjour,

Est-il possible d'installer l'outil Kmerator2 pour la recherche de khmers spécifiques ?
Installation : Installation — CellBender documentation :
pip3 install kmerator

Bien à vous,

Quentin Bouvier

Bonjour,

Le plus simple est de charger python et d'installer via pip ce module:

# Charger le module python que l'on souhaite utiliser
module load python/3.9 

# Installer kmerator dans son répertoire personnel 
pip install --user kmerator

Par contre ça marche pas dans mes tests (il faut le signaler au mainteneur) :expressionless:

Vous pouvez essayer d'utiliser la deuxième solution proposée:

git clone https://github.com/Transipedia/kmerator.git
~/kmerator/kmerator/kmerator.py

Bonne journée

Bonjour et merci,

L'installation a fonctionné de mon côté avec le pip install.

Bonne journée.

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