Demande d'installation/mis à disposition de Cytoscape

IFB Core Cluster Demande de logiciel ou de banque de données
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Bonjour la team,

Dans le cadre d'une formation IFB (ETBII), nous avons prévu de nous reposer sur le cluster pour l'ensemble des sessions pratiques sauf pour une session pratique utilisant l'outil Cytoscape ou nous avons un doute.
Cytoscape est un outil graphique qui permet de faire de la visualisation et de la manipulation de réseaux.

Je souhaiterai savoir si c'est possible d'avoir cette outil disponible via Open OnDemand ou le bureau distant ou autre idée ?

Si c'est possible c'est top si c'est pas possible pas grave, faut qu'on réfléchisse à comment articuler les sessions pratiques entre elles.

Au cas où :

Merci d'avance,

Une bonne journée,

Lucie K

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Hello Lucie,

Nous avons échangé via chat mais je donne une réponse officielle.

Nous avons fait un déploiement rapide de cytoscape 3.10.1 qui est disponible uniquement sur le Core Cluster via module load cytoscape/3.10.1
Il semble que cytoscape ne permette pas de faire une installation mutualisé d'apps. Ainsi nous ne pouvons pas ajouter des apps supplémentaire disponibles pour tous. En revanche, chaque utilisateur peut ajouter des apps sur cytoscape. L'installation est faite alors dans le homedir de l'utilisateur.

Merci de nous faire un retour si l'usage de Cytoscape est ok depuis l'app Desktop d'Open OnDemand.

Bonne journée,

Julien