Bonjour,
Est-il possible d'installer l'outil phyloFlash et sa banque de données pré-formatée (SILVA 138.1 depuis l'archive zenodo donnée) ?
phyloFlash est destiné à reconstruire des séquences SSU rRNA, et donc à analyser la composition phylogénétique d'un ensemble de données métagénomiques/métatrascriptomiques.
Merci beaucoup !
Bonjour,
phyloFlash est à présent disponible sur le core cluster de l'IFB.
Vous pouvez charger l'outil dans votre environnement en utilisant la commande : module load phyloflash/3.4.2
Les bases de données pré-formattées SILVA 138.1 ont été installées dans /shared/bank/phyloflash/SILVA/138.1
Merci à @_Popy pour l'aide au déploiement.
Julien