Demande d'update SMRT Link vers 13.1 @team.software

IFB Core Cluster Tool or data bank request
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Bonjour @team.software,
serait-il possible d'installer la version 13.1 des SMRT link tools?

La version disponible sur l'IFB est la 10.1 (smrtlink-tools/10.1.0.119588)
Merci!
Pascal

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Pardon pour le retard, je m'y mets de ce pas

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Le package conda Files | Anaconda.org n'est plus mis à jour.

Par contre, les outils de la suite smrtlink-tools semblent au moins en partie disponible individuellement sur bioconda. Quel ou quelles outils vous intéresse ?

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Bonjour,
merci de ce retour.
Pour l'instant j'ai utilisé les outils suivants (tous les deux dans pbtk):

  • pbindex
  • bam2fastq

Mais j'aurai également besoin des outils suivants prochainement:

  • isoseq
  • jasmine
  • pbsv
  • trgt

Merci d'avance

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Hop:

module load pbtk/3.1.1

module load pbsv/2.9.0

module load isoseq/4.0.0

module load pbjasmine/2.0.0

module load isoseq/4.0.0
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