Désinstallation de versions d'outils utilisant des packages Anaconda

Pour garantir le respect strict des conditions d'utilisation des packages Conda développés par la société Anaconda, nous avons décidé de désinstaller certaines versions d'outils qui dépendent des packages provenant des canaux defaults d'Anaconda.

Ces versions concernent principalement des outils anciens, pour lesquels des versions plus récentes sont déjà disponibles sur le cluster.

Voici la liste complète des versions d'outils désinstallées :

  • agat v0.8.0
  • antismash v6.1.1
  • anvio v6.1
  • busco v4.0.5
  • concoct v1.1.0
  • deepvariant v1.0.0
  • delly v0.7.9
  • epic2 v0.0.41
  • frogs v3.1.0
  • glimpse v1.1.1
  • hicstuff v2.3.0
  • maker v3.01.03
  • mash v2.3
  • medaka v1.0.3
  • medaka v1.1.3
  • medaka v1.4.1
  • mercat v0.2
  • metabolic v20210303
  • metawrap v1.2
  • paleomix v1.3.6
  • panaroo v1.2.10
  • picrust2 v2.1.1_b
  • qiime2 v2019.1.0
  • rgi v6.0.1
  • salmon v0.11.3
  • snakemake v6.14.0
  • stream v0.4.1
  • topaz v0.2.5

Si vous avez un besoin impératif d'utiliser l'une de ces versions, veuillez nous contacter afin que nous puissions procéder à une nouvelle installation sans dépendre des packages Anaconda.