Disk quota exceeded - Arima5

IFB Core Cluster Account and project management
1

Bonjour

Comme plusieurs sujets publiés, j'ai moi aussi un problème au lancement de Jupyter avec ce message d'erreur : "Disk quota exceeded @ dir_s_mkdir - /shared/home/tmatis/ondemand/data/sys/dashboard/batch_connect/sys/jupyter/core/output/0969a2f5-b38c-4b50-9710-c094fc3c9eee". Pourtant, je n'ai pas généré de dossier ou fichier depuis des semaines.
Comment puis-je régler ce problème ?

En vous remerciant d'avance pour votre aide

Cordialement

Thibaut

2

Bonjour Thibaut,

Votre "home directory" est plein.
Vous avez atteint la taille maximale (143.1Go utilisé, quota de 100G) et le nombre maximal de fichiers (100070 fichiers, quota de 100000).
Pour visualiser: lfs quota -h -p 164083 /shared/home/tmatis

Disk quotas for prj 164083 (pid 164083):
     Filesystem    used   quota   limit   grace   files   quota   limit   grace
/shared/home/tmatis
                 143.1G*   100G    150G    none  100070* 100000  150000    none

Concernant le nombre de fichiers, en général, c'est causé par l'installation des paquets conda, python ou R.
Dans votre cas:

  • ~/.conda, ~60000 fichiers (envs et pkgs)
  • /.local/lib/python3.9, ~44000 fichiers

Concernant la taille, ce sont souvent des données scientifique (projet)
Dans votre cas:

  • ~/Jose_files, 129Go

Il faut donc nettoyer en supprimant ou en déplaçant les données dans vos espaces projets, sous peine de rencontrer de nombreux problèmes.

Bon après-midi

3

Merci beaucoup pour l'explication.
Je vais suivre vos recommendations

4

Bonjour

J'ai de nouveau ce message alors que je n'ai rien généré à part des images de quelques kb et 2 ou 3 scripts. J'ai quand même supprimé 8Go, rien n'y fait. Pour ce qui est de mon home je n'ai rien ajouté depuis. Est ce une question du nombre de fichiers ?

Encore merci d'avance pour votre aide

Thibaut

5

Bonjour,

Oui. C'est bien une question du nombre de fichier:

     Filesystem    used   quota   limit   grace   files   quota   limit   grace
/shared/home/tmatis
                 13.94G    100G    150G       -  100070* 100000  150000    none

Vous avez toujours 100070 fichiers (max 100000).

Principalement dû à vos environnement conda (65k fichiers, .conda) et vos package python (44k fichiers, local/lib/python3.9)