Je souhaite réaliser un criblage virtuel de 2 librairies de molécules sur de multiples cibles virales. Pour cela, j'aimerais utiliser les outils suivants : DockingApp et DockingApp RF (en Java, disponibles ici pour toutes les plateformes : http://www.computationalbiology.it/software.html). Ces applications permettent de réaliser des études de docking de façon intuitive pour les non-experts. Serait-ce possible de les ajouter aux outils disponibles ?
Par avance merci,
Baptiste MARTIN
Le déploiement de DockingApp est en cours ici : https://gitlab.com/ifb-elixirfr/cluster/tools/-/merge_requests/103
DockingApp et DockingApp_RF ne sont pas "packageables" et ainsi ne peuvent pas être mis à disposition de l'ensemble des utilisateurs des infrastructures de calcul.
En effet, le logiciel nécessite d'écrire dans son répertoire d'installation lors de son utilisation ainsi nous ne pouvons pas proposer une installation commune pour tous.
Nous avons finalement opté pour une installation propre de mgltools (disponible via module pour tous) et une installation manuel de DockingApp de DockingApp_RF dans votre dossier projet.
Les instructions pour lancer l'outil sont données dans le sujet Demande d'accompagnement sur un projet de docking