Download Hmdb tool


I keep getting this message

Hi,

We are experiencing some issues with the connection to HMDB tools.

We will correct that as soon as possible

Best

Bonjour,
Nous avons de nouveau des soucis de connexion à la base HMDB.
L'outil Galaxy | France

ne donne que des datasets de taille 0.

@Lain je me demande si l'API HMDB n'a pas changée avec la sortie de leur version 5.0 https://hmdb.ca/

Merci

Hello!
Effectivement, il lme semble (je ne connais pas l'ancienne API) qu'il y a eu des changements.
Je ne suis pas sure de ce que j'avance, mais j'ai l'impression que:

  • le csrf token n'est plus dans le header, mais dans l'x-www-form-urlencoded (en français: le token d'autentification de la requête n'est plus au même endroit) ; il s'appel maintenant "authenticity_token"
  • les champs de l'urlencoded ne contiennent plus d'espaces ; ils ont été remplacés par des "+".

J'sais pas s'il est sensé y avoir un changelog quelque part, j'le trouve pas...

Ah, et il y a deux champs qui sont présents dans l'appli web, mais que je ne vois pas dans les requêtes de hmdb ms search:

  • ccs_predictors
  • ccs_tolerance

J'sais pas si ils sont nouveaux(/devenus) obligatoires, mais ils sont utilisés dans l'appli web.

Bonjour @Lain

Merci d'avoir cherché, je confirme que les champs ccs sont nouveaux. Pour les autres paramètres je pense que c'est pareil.

Bonne journée