Bonjour,
je suis stagiaire du DUBii (débutant avec l’utilisation du cluster et linux).
j’ai voulu utiliser multiQC sur mes QC et ne pouvant pas, j’ai fait conda install -c bioconda multiqc mais j’ai arrêté quand il a fallu updater un certain nombre d’autres choses. Je me suis dit qu’il valait mieux voir avec vous d’abord.
A-t-on besoin d’installer multiqc ? Peut-on à l’avenir installer ce type d’outils nous-même ?
Merci pour votre aide.
Bonjour et bienvenue @Semih,
multiqc est d’ores-et-déjà disponible sur le cluster
$ module load multiqc/1.6
$ multiqc --version
multiqc, version 1.6
Pour l’installation de nouveaux outils, nous préférons les centraliser le plus possible pour un gain de place en terme d’usage disque et ceux d’autant plus quand le package est disponible sous Conda.
Donc n’hésitez pas à nous faire remonter un besoin en outil sur ce site ou à participer si le coeur vous en dit à ce dépôt git: https://gitlab.cluster.france-bioinformatique.fr/taskforce/conda-env
merci pour la réponse et la réactivité 
je vais bien vérifier à l’avenir
coucou Semih !
Dubii too
module avail -l n’est-ce-pas ?
Hello Anne-Marie,
merci !
(je viens de voir (et de piger) le message 
)