Bonjour,
Dans le cadre d'un workflow galaxy je souhaite utiliser eggnog mapper. La phase seed orthologs passe mais pour la phase annotation j'ai ce message d'erreur : This job was terminated because it ran longer than the maximum allowed job run time. J'ai eu ce message plusieurs fois et je n'ai jamais réussi à aller au bout de cette étape. Est-il possible d'augmenter le temps de run pour les jobs de la phase d'annotation d'eggnog mapper ? Sinon quelles solutions sont envisageables ?
Merci
Bonjour,
je viens de faire la demande pour que l'outil tourne 24h de plus qu'à présent.
Ce sera disponible prochainement quand la Merge Request sera fusionnée increase eggnode time to 72h (!1060) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / usegalaxy.fr / infrastructure · GitLab
Thomas
Merci !
Bonne journée,
Hugo
Bonjour, malgré l'augmentation à 72h, mon job eggnog est retombé en erreur pour la même raison. Ce ne sont pourtant pas de si gros jeux de données que ça. Est ce qu'une nouvelle augmentation est possible ou alors ce problème est peut-être dû à d'autres choses ?
Merci
Hugo