Bonjour Quentin,
Pouvez-vous simplement réessayer en chargeant au prélable le module Perl:
module load perl/5.26.2
La librairie Bio::DB::BigFile devrait alors être disponible.
Pour le reste (fichier manquants pour les plugins ou librairie manquante), nous nous appuyons beaucoup sur les paquets conda et particulièrement sur le dépôt bioconda. Si ça vous semble souhaitable, vous pouvez alors ouvrir une issue et demander d'intégrer ces fichiers dans le paquet conda: bioconda-recipes/recipes/ensembl-vep at master · bioconda/bioconda-recipes · GitHub