| Traceback (most recent call last):
| File "/shared/mfs/data/galaxy/mutable-data/shed_tools/toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/prog/isa2w4m/1883d5274962/isa2w4m/isa2w4m.py", line 8, in <module>
| isatab2w4m.main()
| File "/shared/mfs/data/galaxy/mutable-data/dependencies/_conda/envs/__isatools@0.10.3/lib/python3.8/site-packages/isatools/convert/isatab2w4m.py", line 569, in main
| convert(input_dir = args_dict['input_dir'],
| File "/shared/mfs/data/galaxy/mutable-data/dependencies/_conda/envs/__isatools@0.10.3/lib/python3.8/site-packages/isatools/convert/isatab2w4m.py", line 548, in convert
| assays = convert2w4m(input_dir = input_dir,
| File "/shared/mfs/data/galaxy/mutable-data/dependencies/_conda/envs/__isatools@0.10.3/lib/python3.8/site-packages/isatools/convert/isatab2w4m.py", line 458, in convert2w4m
| variable_names = make_variable_names(measures_df)
| File "/shared/mfs/data/galaxy/mutable-data/dependencies/_conda/envs/__isatools@0.10.3/lib/python3.8/site-packages/isatools/convert/isatab2w4m.py", line 295, in make_variable_names
| if assay_df.keys().contains(col):
| AttributeError: 'Index' object has no attribute 'contains'
Je vais essayer de reproduire l'erreur en dehors de Galaxy, mais c'est étrange car cela ressemble à un problème de version de package, ce qui ne devrait pas arriver avec conda.
Pas encore. Je suis en train de mettre à jour vers la version 0.12 d'isatools, en espérant que cela résolve le problème.
Je vous préviens lorsque j'ai mis une nouvelle version de mtbls-dwnld disponible sur le toolshed.