Erreur sur HMDB bank downloader

Bonjour @fgiacomoni

Je pense qu'il y a un souci avec HMDB bank_downloader, j'ai testé avec FECES et même si l'outil passe en vert, le dataset est à 0ko

en manuel le lien http://www.fecalmetabolome.ca/system/downloads/current/feces_metabolites.zip fonctionne et permet de télécharger le xml donc a priori le souci n'est pas du côté HMDB mais bon a vérifier

the given bank url (http://www.fecalmetabolome.ca/system/downloads/current/feces_metabolites.zip) and the detected version ar undef -- database download stopped at /shared/ifbstor1/galaxy/shed_tools/toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/fgiacomoni/downloader_bank_hmdb/4373f936111d/downloader_bank_hmdb/downloader_bank_hmdb.pl line 117.

Merci d'avance
Yann

Hello Yann,
je m'en occupe !

Hello @fgiacomoni
j'ai retesté ce soir et 0 ligne dans output

une idée? est-ce Galaxy qui bloque le téléchargement du zip?
Merci

j'ai fait une MR de changement des spec de ressources (augmentation ram) pour le tool sur le repo galaxy mais semble pas avoir été prise en compte... Probleme pour serum (grosse bank)