FATAL Couldn't determine user account information: user: unknown userid

IFB Core Cluster
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Bonjour,

Depuis ce matin, quand je lance de nouveaux jobs avec sbatch mon script échoue avec une erreur 'FATAL Couldn't determine user account information: user: unknown userid'. Cette erreur se produit sur les commandes 'singularity' ou 'git clone'. J'ai lancé le même script il y a trois heures et il tourne correctement. L'erreur est apparue après, quand je lance le même script en parallèle. Le script fonctionne aussi sur un autre cluster.

Auriez-vous une idée de la source du problème ?

Pour info : J'ai aussi des warnings '/usr/bin/bash: /shared/ifbstor1/software/miniconda/envs/tmux-3.1/lib/libtinfo.so.6: no version information available (required by /usr/bin/bash)' quand Snakemake active un environnement conda.

Merci,

Thomas Brazier

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Bonjour Thomas,

Le noeud sur lequel a tourné le job était en souffrance (l'authentification LDAP ne se faisait pas correctement, ce qui renvoi unknown userid). Ce qui est étrange, c'est que le job soit passé sur ce même noeud...
Dans tous les cas, on drain le noeud pour le redémarrer et repartir sur une situation stable.
Bref, l'erreur ne devrait pas se reproduire.
N'hésitez pas à revenir vers nous dans le cas contraire.

Pas d'idée pour le warning par contre...

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Merci.

Le warning ne semble pas lié et n'impacte pas les résultats.

Bonne journée