Bonjour à tous 
Je suis actuellement en train d'assembler un métagénome avec Flye... Et j'ai rencontré un petit problème de mémoire :
[2021-09-27 16:27:05] INFO: Starting Flye 2.8.1-b1676
[2021-09-27 16:27:05] INFO: >>>STAGE: configure
[2021-09-27 16:27:05] INFO: Configuring run
[2021-09-27 16:47:23] INFO: Total read length: 85006941905
[2021-09-27 16:47:24] INFO: Input genome size: 100000000
[2021-09-27 16:47:24] INFO: Estimated coverage: 850
[2021-09-27 16:47:24] INFO: Reads N50/N90: 11120 / 5937
[2021-09-27 16:47:24] INFO: Minimum overlap set to 3000
[2021-09-27 16:47:24] INFO: >>>STAGE: assembly
[2021-09-27 16:47:24] INFO: Assembling disjointigs
[2021-09-27 16:47:24] INFO: Reading sequences
[2021-09-27 17:03:44] INFO: Counting k-mers:
0% 10% 20% 30% 40% 50% 60% 70% 80% 90% 100%
[2021-09-27 17:34:47] INFO: Filling index table (1/2)
0% 10% 20% 30% 40% 50% 60% 70% 80% 90% 100%
[2021-09-27 18:46:07] ERROR: Looks like the system ran out of memory
Je sais qu'il est possible de diminuer le nombre de lectures prises en compte par Flye, ce qui aurait pour effet de diminuer son coût en RAM. Malheureusement je ne peux pas utiliser cette méthode car il s'agit ici d'un métagénome, et il est déconseillé par les auteurs de l'utiliser dans ce cas là. De plus, les données de mon échantillon ne me permettent pas de le faire (perte d'informations trop importante).
Je me demandais donc s'il était possible d'accéder à une plus grosse quantité de RAM, de manière éphémère, pour lancer cet assemblage.
En vous remerciant par avance,
Aurélie