Installation banque RpoB FROGS sur usegalaxy.fr

Bonjour,

il y a maintenant une DTB RpoB pour FROGS. Serait-il possible de l'installer sur le usegalaxy.fr ?

Voilà le lien:
https://genoweb.toulouse.inra.fr/frogs_databanks/assignation/rpoB/

N'hésitez pas si vous avez besoin d'informations supplémentaires.

Merci d'avance.

Salut,
Qu'en penses-tu @geraldinepascal, c'est installable via le data manager frogs ?
Anthony

HEllo,

C'est effectivement tout à fait possible.
Sur l'interface du datamanager il suffit de sélectionner (écrire) l'amplicon rpoB. Comme nous n'avons qu'une seule version de cette base INRAE, les autres filtres ne sont pas nécessaire.

@kgazengel, je me permet de rappeler les info pour la citation de cette base :
https://genoweb.toulouse.inra.fr/frogs_databanks/assignation/rpoB/readme.txt

rpoB database is provided by DGiMi laboratory from INRA Montpellier : (https://www6.montpellier.inra.fr/dgimi)
For more details and citation, please refer to : https://doi.org/10.1186/s12866-019-1546-z

Please contact Jean-Claude Ogier (Jean-Claude.Ogier@umontpellier.fr) for any questions

Je crois que c'est bon, vous pouvez tester ?