Installation de filtlong

IFB Core Cluster Demande de logiciel ou de banque de données
#1

Bonjour,

Je cherche à filtrer des long reads (Pacbio) avant de lancer un assemblage de novo.
Je me demandais s'il était possible d'installer le logiciel filtlong qui spécialisé dans les long reads ( https://github.com/rrwick/Filtlong ) ? Ou est-ce qu'un autre logiciel adéquat est déjà présent ?

Merci par avance,
Aurélie.

#2

Bonjour Aurélie,

Je ne saurais répondre si Filtlong est le logiciel adéquat mais nous venons de l'installer en v0.2.0 :slight_smile:
Comme d'habitude:

module load filtlong

Bon après-midi

[edit] Pour voir la cuisine interne: https://gitlab.com/ifb-elixirfr/cluster/tools/-/merge_requests/85

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