Bonjour,
Je souhaiterai installer la librairie python Hail sur le cluster. Elle permet de traiter la banque de données gnomAD qui est déjà disponible sur le cluster mais je ne la trouve pas.
https://hail.is/docs/0.2/install/linux.html
Merci!
Fanny
Bonjour @fpouyet, nous n'avons pas pour habitude d'installer des librairies python dans les versions chargeables par module, mais vous pouvez installer la librairie hail localement (dans votre home /shared/home/fpouyet par exemple).
Pensez a vous connecter a un noeud de calcul avec srun --pty bash, et lancez depuis votre home:
module load python/3.9
python3 -m venv .hail
source .hail/bin/activate
pip install hail
J'ai testé l'import de la librairie dans la console python et ca a l'air de fonctionner, mais n'hésitez pas a réouvrir le sujet si vous rencontrez des problèmes avec cette installation locale.