Installation de LongQC

Bonjour,

Serait-il possible d'installer LongQC https://github.com/yfukasawa/LongQC qui permet de générer un rapport qualité pour les long reads.
Sauf erreur de ma part, il n'est pas disponible sur le cluster.

Merci de votre aide
Très bonne journée
Marion

Bonjour @Marion,

C'est disponible sur le cluster: https://gitlab.com/ifb-elixirfr/cluster/tools/-/merge_requests/244

En chargeant le module suivant:

module load longqc/1.1.1

Ça a l'air de fonctionner, au moins pour afficher l'aide:

C'est probable que l'installation ne soit pas parfaite, si vous rencontrez un souci en l'utilisant, alors n’hésitez pas à nous en informer.

Bonjour @Francois

Merci beaucoup !! Je vais le tester de ce pas...