bonjour,
je tente de réaliser une analyse en suivant un tuto du galaxy training qui s'appelle Genome-wide alternative splicing analysis (Hands-on: Genome-wide alternative splicing analysis / Transcriptomics).
cependant il manque certains outils qui ne sont pas dans disponibles:
certains sont sur le tool shed: CPAT et pfamscan (mais il faut aussi installer les banques de PfamHMM) et un autre outil non sur le tool shed: IsoformSwitchAnalyzeR
et par ailleurs, il manque egalement un bloc de la suite cufflinks, qui s'appelle cuffdiff
pensez-vous qu'il soit possible d'installer ces outils?
par avance mille mercis!!!!
tom