Bonjour à toute l'équipe,
serait-il possible d'installer qualimap dans sa version 2.3 ?
En effet, nous avons un souci de reproducibilité dans les analyses de la formation prévue pour la semaine prochaine avec la version actuelle 2.2.2-dev.
L'analyse bamqc tourne comme l'an dernier, mais l'analyse rnaseq plante systématiquement avec la version la plus récente de l'annotation du génome souris (M35 sur GRCm39).
Il est possible que la version 4.3 ne pose plus ce problème.
Et sinon, on pourra se rabattre sur la version du génome et de la référence utilisées l'an dernier, mais ce n'est pas optimal.
Merci d'avance !
Sandrine