Installation des logiciels alientrimmer et prodigal

Bonjour,

Afin de préparer au mieux la rentrée avec les étudiants du master paris 7, je souhaiterais l'installation:

Cordialement,
Amine Ghozlane

Bonjour,

Prodigal est disponible dans conda:
https://anaconda.org/bioconda/prodigal
Est-ce que cette version vous conviendrez ?

Concernant gcj, il y'a aussi un package dans conda, mais qui semble un peu vieux (et je ne suis pas sur qu'il soit complet pour compiler):
https://anaconda.org/anaconda/libgcj-cos6-x86_64

Du coup plus de déploiement possible dans module ?

Excusez moi, j'ai du mal m'exprimer. Je cherche juste à lancer la conversation pour trouver la meilleur solution technique pour répondre a votre besoin.

Je ne pense pas avoir dit qu'on ne les installerai pas :wink:

Si je parle de conda, c'est parce que la plupart des outils disponible avec "module" sur le cluster sont en fait installé à partir de conda.

Ok, la version de prodigal sur anaconda correspond à la dernière version prodigal, ça me va très bien.

Je vais voir pour faire un package pour alientrimmer sur conda.

Bonjour,

Trés bien, prodigal est en cours d'installation:

J'ai déployé Alientrimmer sur mon conda: https://anaconda.org/aghozlane/alientrimmer
Est ce que c'est bon pour l'installer ?

Bonjour et merci !

Installation en cours: