Installation Eagle2 et cellsnp-lite

IFB Core Cluster Demande de logiciel ou de banque de données
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Bonjour @team.software,
Serait-il possible d'installer Eagle v2.4.1 (Eagle v2.4.1 User Manual) et cellsnp-lite (GitHub - single-cell-genetics/cellsnp-lite: Efficient genotyping bi-allelic SNPs on single cells) ?
Merci beaucoup pour votre aide

Martin

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Bonjour,

Eagle v2.4.1 n'est pas "packagé" (par exemple sous conda). Ce qui rends l'installation plus fastidieuse pour nous (création de container, etc). Nous manquons actuellement de ressources pour réaliser ce module.
Mais Eagle fournit un binaire utilisable simplement. Il suffit de le télécharger comme suit:

# Télécharger 
wget https://storage.googleapis.com/broad-alkesgroup-public/Eagle/downloads/Eagle_v2.4.1.tar.gz
# Décompresser
tar -xzvf Eagle_v2.4.1.tar.gz
# Utiliser eagle:
./Eagle_v2.4.1/eagle -h

En espérant que cela vous convienne.

cellsnp-lite v1.2.2 est en cours d'instalaltion:

On reviens vers vous dès que cellsnp-lite est installé.

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cellsnp-lite v1.2.2 est maintenant disponible. Comme d'habitude:

module load cellsnp-lite/1.2.2
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Merci beaucoup