Bonjour
Serait-il possible d'installer s'il vous plait :
Je ne les ai pas trouvé sur le Cluster.
Je n'ai pas de contraintes de version.
J'espère vous avoir fourni les informations qu'il vous faut.
Merci
Emilie
Bonjour à tous
Finalement, après différentes discussions et recherches, je ne vais pas avoir besoin de DISCASM, GMAP et GMAP-fusion (je souhaite faire une annotation de novo complémentaire de l'annotation faite avec le génome et on m'a conseillé PASA qui est plus complète).
En revanche, serait-il possible que vous m'installiez PASA pipeline : https://github.com/PASApipeline/PASApipeline/releases
Et toujours StringTie aussi.
Ce serait super
Merci beaucoup !
Bonne soirée
Emilie
Pas de soucis, je vois ça rapidement
C'est en cours d'installation : Denovo (!189) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / Cluster / tools · GitLab
J'en ai profité pour faire installer toute la liste si vous changer d'avis
Ah merci !
C'est trop gentil ! Vous êtes super !
Bonne journée
Emilie
Hop :
module load discasm/0.1.3
module load gmap-fusion/0.4.0
module load gmap/2020.06.01
module load pasa/2.4.1
module load stringtie/2.1.2