Installation PARE

Bonjour,
J'ai un problème lors de l'installation de spundhir/pare depuis github (GitHub - spundhir/PARE: PARE: a computational method to Predict Active Regulatory Elements), spécifiquement quand j'essaye d'installer un module perl dont le programme a besoin avec la commande "sudo cpan Tie::IxHash Statistics::Basic", comme on a pas le droit d'installer les module dans l'espace partagé. Est ce que c'est possible d'installer ce module de votre coté (v0.08)?

Merci,
Hassan

Bonjour,

L'installation de module (perl, python, R, etc) peut se faire sans droit particulier (le module est alors installé dans son répertoire personnel).

cpan le fait d'ailleurs automatiquement.
Il faut simplement indiquer la méthode d'installation 'local::lib'.
Et demander à cpan d'ajouter les paramètres dans sont .bashrc
Exemple ici pour installer le module cpanm:

$ cpan App::cpanminus
[...]
What approach do you want?  (Choose 'local::lib', 'sudo' or 'manual')
 [local::lib] 
Attempting to create directory /shared/home/dbenaben/perl5
[...]
Would you like me to append that to /shared/home/dbenaben/.bashrc now? [yes] yes
[...]
Installing /shared/home/dbenaben/perl5/lib/perl5/App/cpanminus.pm
[...]
  MIYAGAWA/App-cpanminus-1.7048.tar.gz
  /usr/bin/make install  -- OK

A noter qu'il faut (la première fois) se déconnecter/reconnecter ou charger de nouveau le .bashrc (source .bashrc) pour que les modules installées soient pris en compte.

Bonne journée

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Merci beaucoup pour votre aide !