Bonjour,
J'essaie de faire tourner interproscan sur un fichier de séquence protéique.
Et malgré plusieurs essaies, je ne réussi à faire tourner interposcan avec succès que en utilisant srun.
En soumettant le même code avec sbatch, ça tourne pendant quelques heures (au lieu de quelques minutes), puis je reçois un NODE FAIL:
"slurmstepd: error: *** JOB 26506110 ON cpu-node-10 CANCELLED AT 2022-10-11T04:15:49 DUE TO NODE FAILURE, SEE SLURMCTLD LOG FOR DETAILS ***"
Je fais peut être quelque chose d'idiot, je viens de m'inscrire sur IFBcore.
Si quelqu'un peut m'aider ce serait cool?
Cordialement,
Nicolas
PS: Mon script est ci-dessous.
#!/bin/bash
#SBATCH -p fast
#SBATCH --cpus-per-task=4
#SBATCH --mem 16
#SBATCH -o slurm.%N.%j.out
#SBATCH -e slurm.%N.%j.err
module load interproscan/5.55-88.0
InterproScan.sh -o /shared/home/nnalpas/BACTpredict/DB/Abaumannii/Interpro -t 4 /shared/home/nnalpas/BACTpredict/DB/Abaumannii/ATCC17978_plasmides_20220912_SUB.fasta