Bonjour,
J'ai lancé mon TP pour 30 étudiants comme convenu sur la session TlaaS ueomiq2.
Dès l'étape de Fastqc, de grosses lenteurs observées, certains jobs ne sont toujours pas terminés après au moins 10mn.
Pouvez vous allouer plus de ressources sur cette session svp ?
Merci à vous,
Bertrand
Salut @bcosson
Etrange, je ne vois pas de jobs sur l’interface UseGalaxy.fr TIaaS ueomiq3 Status !?
Nous avons eu un problème hier avec SLURM mais là, cela semble de notre point de vu revenu à la
normal.
Tous les jobs Galaxy sont actuellement RUNNING et aucun ne sont en PENDING. Côté SLURM, je vois peu de job FAILED depuis 24h.
Du coup, je ne sais pas trop ...
Quand tu dis lent, c'est sur quelle étape : gris, jaune ?
As-tu un historique à me partager ?
Fait à partir de galaxy, un historique avec juste hisat planté, l'autre avec tous les jobs qui ont planté dans l'historique d'un étudiant, partagé à ton adresse mail ainsi que celle de Thomas, Merci !
Pour la session de cet aprs midi quelques étudaints ont réussi à lancer leur analyse Hisat2, d'autres seuelment pour certains fichiers, et pour la majorité les jobs ont planté.
Merci de votre aide
Bonjour,
Avez-vous pu identifier l'origine des problèmes ?
J'ai un TP demain matin avec 40 étudiants, réservée comme les autres sur TlaaS,
Merci de votre aide,
Bertrand
Bonjour,
Je retrouve le même problème ce matin: impossible de lancer Hisat2.
Merci de votre aide,
Bertrand