Met4j : association runner - application

Bonjour,

La version 1.4.0 de met4j-galaxy vient tout juste d'etre enregistrée sur le toolshed. Elle contient une nouvelle application : SBMLWizard. Pour éviter une mauvaise association entre le runner et l'application, il est nécessaire de l'ajouter dans le fichier production/files/dynamic_rules/tool_destinations.yaml (comme dans la merge request 782).

Bonne journée,
Ludo Cottret

Salut @Ludo_Cottret,

Est ce que tu peux me donner le nom et l'id de votre nouvel outil ?

Thomas

Salut Thomas,

Le nom est SBMLWizard et l'id est : toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/metexplore/met4j/met4j_SBMLwizard/1.4.0

Ludo

Salut @Ludo_Cottret

Je viens d'ajouter une conf à met4j_SBMLwizard https://gitlab.com/ifb-elixirfr/usegalaxy-fr/infrastructure/-/merge_requests/835
L'outil devrait être disponible lundi prochain.

thomas

Merci beaucoup !

Bonjour,

Une nouvelle application a été ajoutée à met4j, on a oublié de vous prévenir et du coup l'association entre le runner et l'application ne s'est pas faite.
Le nom de l'application est ORApathwayEnrichment : toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/metexplore/met4j/met4j_ORApathwayEnrichment/1.5.0.

Pouvez-vous s'il vous plait l'ajouter dans le fichier production/files/dynamic_rules/tool_destinations.yaml (comme dans la merge request 782) ?

Bonne journée !
Ludo Cottret

Salut @Ludo_Cottret

c'est en cours : add met4j_ORApathwayEnrichment conf (!868) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / usegalaxy.fr / infrastructure · GitLab
ça sera bientôt disponible

Thomas

Merci Thomas !
Désolé, il y a aussi une autre nouvelle app qui a un probleme de runner :
TopologicalPathwayAnalysis : toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/metexplore/met4j/met4j_TopologicalPathwayAnalysis/1.5.0 . Est ce que vous pouvez la rajouter svp ?
Ludo

c'est en cours : add met4j_TopologicalPathwayAnalysis conf (!869) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / usegalaxy.fr / infrastructure · GitLab

Merci beaucoup pour cette réactivité !