Hello,
Dans mon labo on envisage d’acquérir un Minion nanopore pour du genomique / barcoding / metabarcoding. Je me pose la question, est ce que c’est faisable de faire le base calling, (après acquisition des données en local), sur le Cluster de l’IFB, je crois qu’il faut 1 gpu, mais sinon je vois pas pourquoi ce ne serait pas possible, je demande quand même au cas où.
Certains ont pratiqué ici ? merci d’avance,
bon aprem !
Oui, c’est possible.
Je le fais régulièrement sur le noeud GPU.
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