Bonjour,
Serait-il possible de mettre a jour AlphaFold s'il vous plait ? 
La derniere version est 2.3.1 Releases · deepmind/alphafold · GitHub
Merci par avance,
Matthieu
Bonjour Matthieu,
Les travaux sont en cours !
Vous pouvez suivre l'avancé des déploiements ici : Added: AlphaFold v2.2.2 and v2.2.3 installation files for conda (!888) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / Cluster / tools · GitLab
Bonjour Julien,
Merci beaucoup. Je ne vois pas les avancées pour AlphaFold v2.3.1, mais si c'est en cours c'est top. Bon courage !
Matthieu
Bonjour Matthieu,
entre temps la version 2.3.2 est sortie.
Par curiosité, quels sont les avantages significatifs des versions 2.3.x par rapport à la version actuellement installée (2.2.3) ? Avez vous des cas particuliers qui ne sont pas pris en charge par la version actuellement fonctionnelle sur le cluster ?
Cordialement,
Sylvain
Bonjour,
La principale amélioration se trouve dans les modèles multimers et l’utilisation de la mémoire. Avec cette version, la prédiction de l’interface entre deux protéines est beaucoup plus fiable ( alphafold/technical_note_v2.3.0.md at main · deepmind/alphafold · GitHub )
Pour moi l’intérêt est de pouvoir mettre à jour AlphaPullDown ( GitHub - KosinskiLab/AlphaPulldown ) qui nécessite pour la v2.3
Matthieu
1 « J'aime »
Bonjour,
Est-ce qu'il est prévu de mettre à jour AlphaFold bientôt sur le cluster ?
Cordialement,
Matthieu