Multi python avec module load python/3.7

IFB Core Cluster
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Bonjour,
Je cherche à lancer un workflow snakemake mais j'ai des souci de librairies python.
en cherchant je remarque plusieurs bug:

  • des versions de python sont charger par défaut (2.7 + 3.6)
  • après le chargement de python/3.7 avec le module load on obtient les versions suivantes dans le PATH:2.7,3.6,3.7,3.9
  • dans mon workflow il me faut le module R: r/4.1.0, mais celui-ci charge aussi python3.9....

Bref c'est du coup impossible de n'avoir qu'une seul version de python dans le PATH....
Merci d'avance

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Bonjour,

Pouvez nous partager le ou messages d'erreur correspondant au souci de librairie python ?

En effet :

  • Python est installé sur toute les machines, c'est surtout pour Ansible et autre outil de déploiement/configuration/gestion du parc.
  • Python est aussi dans le module R, parceque certain package R utilise des modules python (mofapy par exemple)

Si ca pose un souci,alors vous pouvez sans doute redéfinir PATH avant de lancer votre workflow.

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j'avais juste un librairie not found car il prenais le path du python 3.9 alors que mes lib étaient dans le path python3.7...,
En modifiant l'ordre de chargement des modules+ PATH+PYTHONPATH j'arrive a lancer le workflow,
Mais pas très intuitif pour les utilisateurs novice et un peut perturbant d'avoir plusieurs versions dans le PATH....