Non execution de MSNBase dans les workflows

Bonjour,
Depuis la mise à jour du Jeudi 25 Mai, je ne parviens plus à lancer de worfklows contenant MSnbase readMSData. Lorsque lancé indépendamment des Workflows ce module ne pose aucun problème, mais lorsque utilisé suite à un Input Dataset Collection, l'erreur suivante apparaît désormais: 'NoneType' object has no attribute 'serialize'
Cela est-il du à la mise à jour ou à une erreur de ma part? Cette étape ne posait pas de problèmes précédemment.
Merci

Bonjour,
Désolé pour le délai, la période est chargée pour toute l'équipe.
Le problème est connu, on essaye de trouver une solution le plus vite possible.
Anthony

Bonjour @abretaud

Avez-vous une piste pour faire avancer la résolution de ce bug? Cette brique est la porte d'entrée de bcp de nos workflows de métabolomics.

Merci d'avance pour l'énergie consacrée à ce bel outil qu'est usegalaxy.fr
Yann

Bonjour @yguitton,

Anthony a ouvert une issue pour cette erreur : Problem building metadata with readMSData tool in a workflow on a collection · Issue #16261 · galaxyproject/galaxy · GitHub

Thomas

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Salut @yguitton,
Je pense avoir trouvé une solution (au moins temporaire, cf l'issue sur github). Tu peux tester et confimer que c'est réparé ?
Anthony

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Salut @abretaud

Merci j'ai testé et ça fonctionne de mon côté

Yann