Bonjour @team.alphafold @team.ifbcorecluster @team.bank
J'ai eu cette l'erreur ici (voir au-dessous s'il vous plaît) lorsque l'utilisation de Alphafold2:
stderr:
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05:30:00.213 ERROR: In /opt/conda/conda-bld/hhsuite_1645696999782/work/src/ffindexdatabase.cpp:11: FFindexDatabase:
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05:30:00.213 ERROR: could not open file '/shared/bank/alphafold2/current/2.3/uniref30/UniRef30_2021_03_cs219.ffdata'
srun: error: gpu-node-02: task 0: Exited with exit code 1
Il me semble que c'est apparaît parce que les droits de dossier 'uniref30' ne sont pas ouvert (voir au-dessous s'il vous plaît):
[apereira@core-login1 scripts]$ cd /shared/bank/alphafold2/current/2.3/uniref30/
[apereira@core-login1 uniref30]$ ls -l
total 215592148
-rw------- 1 524602 9100 171469032756 Jul 19 2021 UniRef30_2021_03_a3m.ffdata
-rw------- 1 524602 9100 794584753 Jul 19 2021 UniRef30_2021_03_a3m.ffindex
-rw------- 1 524602 9100 7228866880 Jul 19 2021 UniRef30_2021_03_cs219.ffdata
-rw------- 1 524602 9100 716343145 Jul 19 2021 UniRef30_2021_03_cs219.ffindex
-rw------- 1 524602 9100 40534690979 Jul 19 2021 UniRef30_2021_03_hhm.ffdata
-rw------- 1 524602 9100 22673255 Jul 19 2021 UniRef30_2021_03_hhm.ffindex
-rw------- 1 524602 9100 379 Jul 19 2021 UniRef30_2021_03.md5sums
Est-ce que vous pourriez me donner l'accès, s'il vous plaît?
Merci d'avance.
Cordialement,
Allwyn Pereira