Bonjour,
Je rencontre un problème avec le module gtdbtk/2.7.1 disponible sur le cluster. Lors de l'étape classify_wf, j'obtiens l'erreur suivante :
File "/shared/software/miniconda_deployment/envs/gtdbtk-2.7.1/lib/python3.13/site-packages/gtdbtk/split.py", line 385, in map_high_taxonomy
warning_counter += 1
TypeError: 'int' object is not iterable
Après investigation, il semble que le problème vienne d'une incohérence dans le code de GTDB-Tk 2.7.1 : dans classify.py (ligne 381), warning_counter est initialisé comme une liste (warning_counter = []) mais dans split.py (ligne 385), le code essaie de lui ajouter un entier avec += 1.
Pouvez-vous m'aider ?
Cordialement