Problème de chargement de la librairie monocle_2.22.0

IFB Core Cluster Demande de logiciel ou de banque de données
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Bonjour @team.software,

J'utilise Rstudio de l'IFB et je n'arrive pas à charger la librairie monocle (V2).

J'obtiens le message d'erreur suivant :

library(monocle)

Error: package or namespace load failed for ‘monocle’:
 object ‘clusterApply’ is not exported by 'namespace:BiocGenerics'

J'obtiens la même erreur en tentant la réinstallation

BiocManager::install("monocle", lib="~/R/x86_64-conda-linux-gnu-library/4.1", force = T)

Error: object ‘clusterApply’ is not exported by 'namespace:BiocGenerics'
Execution halted

Auriez-vous une idée pour régler ce problème ?

Merci d'avance pour votre aide

Matthieu

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Bonjour,

A priori c'est un souci avec BiocGenerics, On va essayer de corriger le problème directement dans l'environnement global R 4.1 mais en attendant une solution qui marche sur mon compte :

BiocManager::install("BiocGenerics", lib="~/R/x86_64-conda-linux-gnu-library/4.1", force = TRUE)

puis

BiocManager::install("monocle", lib="~/R/x86_64-conda-linux-gnu-library/4.1", force = TRUE)
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Merci pour votre réponse super rapide !

Matthieu