Problème de mémoire?

IFB Core Cluster Gestion de comptes et de projets
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Bonjour,
J'essaie de faire une classification taxonomique avec DIAMOND/nr mais je reçois chaque fois ce message:
slurmstepd: error: Detected 1 oom-kill event(s) in StepId=32293589.0 cgroup. Some of your processes may have been killed by the cgroup out-of-memory handler.
srun: error: cpu-node-23: task 0: Out Of Memory

Est-ce parce que je n'ai pas assez de capacité de calcul?
Merci d'avance pour votre aide.
Bien cordialement

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Bonjour,

L'erreur out-of-memory indique un manque de mémoire vive (RAM).

Il faut essayer en demandant plus de mémoire (option --mem ou --mem-per-cpu).
Par défaut, si vous ne spécifiez rien, vous aurez les options par défaut: soit 1 CPU, 2Go RAM.

Vous pouvez vous assurer du bon usage des ressources (CPU, mémoire, etc) avec la commande seff une fois le job terminé.

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Merci
Je vais essayer.
Cordialement