Problème d'output de l'outil purityX

Workflow4Metabolomics MSMS
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Merci beaucoup!
L'outil n'a plus de problème de mémoire néanmoins je fais maintenant face à un autre problème: la table de sortie attendue apparaît dans la sortie "console" de l'outil mais le .tsv généré est vide.

peakID meanPurity medianPurity   sdPurity  sdePurity  cvPurity pknmPurity
1      1  0.7668987    0.7974175 0.11689277 0.02835066 15.242270       3.00
2      2  0.1617367    0.1486087 0.03161732 0.01195023 19.548638       8.00
3      3  0.9277477    0.9380126 0.08004239 0.03025318  8.627603       2.00
4      4  0.3859825    0.3597241 0.10925345 0.03153875 28.305287       9.75
5      5  0.1835078    0.1699386 0.04193459 0.01482612 22.851672       8.00
6      6  1.0000000    1.0000000 0.00000000 0.00000000  0.000000       1.00
          i       mz
1  46642.23 50.51572
2  11390.24 51.01612
3  51165.44 51.05732
4  21644.78 51.49571
5  13937.01 51.51464
6 271156.59 53.01843

image

Serait-il possible d'y jeter un coup d'oeil? :face_with_diagonal_mouth:
Merci
Quentin

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Salut Quentin,
Pourrais-tu me partager l'historique concerné s'il te plait ? Je vais essayé de voir.
Mélanie

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Bien sûr!

Je t'ai aussi ajoutée aux usagers partagés.

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Je vais jeter un œil, mais pourrais-tu regarder de ton côté si la toute nouvelle version du wrapper Galaxy de purityX sortie en juin règle ton problème ? :slightly_smiling_face:

:crossed_fingers:

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Effectivement, ça fonctionne avec la version Galaxy Version 1.28.0+galaxy0! Merci

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Nickel !
Bonne journée