Problème etape xcms groupChromPeaks(group)

je tente de générer un fichier xcms à partir de données NetCDF
les étapes Msnbase readMSDATA, xcms findChromPeaks (xcmsSet), et xcms findChromPeaks Merger se sont passées sans problème le fichier Xset.merged.Rdata a été généré sans problème. L'étape xcms groupChromPeaks (group) ne passe pas les noms des 4 fichiers dataMatrix.tsv, variableMetadata.tsv; plotChromPeakDensity.pdf et groupChromPeaks.RData apparaissent mais restent en bleu et même apres une journée aucun des fichiers n'est généré.