Bonjour,
Depuis ce matin je rencontre des problèmes pour lancer les mêmes scripts qui fonctionnait très bien hier. Pour des scripts différents (par exemple un script qui va utiliser le package infercnv et l'autre qui va utiliser le package numbat) j'ai le même genre d'erreur et ça semble être lié aux packages R.
exemple : sbatch -A fungest_mpm --partition=fast --mem=200G --wrap "Rscript /shared/ifbstor1/projects/fungest_mpm/marnould/InferCNV_cell_lines/inferCNV_cell_lines.R
Error: package or namespace load failed for ‘infercnv’ in loadNamespace(i, c(lib.loc, .libPaths()), versionCheck = vI[[i]]):
there is no package called ‘coda’
De plus, lorsque j'ai réessayé d'installer le package numbat j'ai eu une erreur que je n'avais pas eue la première fois.
Savez-vous d'où vient ce problème ?
Merci pour votre aide.