Bonjour à tous,
j'essaye d'utiliser longqc afin d'avoir des stat sur mes données long reads mais malgré la lecture des pages github aucune commande ne fonctionne. je n'arrive même pas à avoir l'aide sur le cluster une fois le module chargé ...
j'ai testé srun python3 longQC.py sampleqc --ont -s ${sample} -p 10 -o ${folder_sampleqc} ${long_read}
srun longQC sampleqc --ont -s ${sample} -p 10 -o ${folder_sampleqc} ${long_read}
j'ai toujours des erreurs de ce type
slurmstepd: error: task/cgroup: unable to add task[pid=18027] to memory cg '(null)'
/shared/ifbstor1/software/miniconda/envs/python-3.7/bin/python3: can't open file 'longQC.py': [Errno 2] No such file or directory
quelqu'un pourrait -il m'aider je ne vois pas ce qui m'échappe ???
Merci ++++ par avance
Chloé