Bonjour,
Je réalise un workflow avec snakeme qui nécessite le module openpyxl dans python, j'ai cette erreur : ModuleNotFoundError: No module named 'openpyxl'.
J'ai vu une erreur ancienne similaire sur le forum, qui a était résolu en mettant snakemake + python + openpyxl dans le même environnement et un "module load snakemake/6.14.0" suffisait. En testant cela, ça marche bien mais j'aurais besoin de la version snakemake/8.0.1, si c'est possible d'installer ce module avec cette version de snakemake.
Merci,
Hassan
Bonjour,
Je me permet de relancer ce sujet. J'ai travaillé jusqu'à maintenant avec la version snakemake/6.14.0, mais il me faut la snakemake/8.0.1 pour d'autres raisons.
Il me semble que je peux pas installer directement openpyxl avec pip ?
Merci,
Hassan
Bonjour @Hassan_Malik ,
snakemake/8.0.1 est déjà installé. Vous pouvez voir la liste des modules snakemake disponibles avec module avail snakemake
.
Pour openpyxl, comme vous l'avez dit vous pouvez utiliser les fonctionnalités de gestion d'environment de snakemake : Additional features - Snakemake 8.0.1 documentation
Bonne continuation
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