Bonjour,
Je réalise un workflow avec snakeme qui nécessite le module openpyxl dans python, j'ai cette erreur : ModuleNotFoundError: No module named 'openpyxl'.
J'ai vu une erreur ancienne similaire sur le forum, qui a était résolu en mettant snakemake + python + openpyxl dans le même environnement et un "module load snakemake/6.14.0" suffisait. En testant cela, ça marche bien mais j'aurais besoin de la version snakemake/8.0.1, si c'est possible d'installer ce module avec cette version de snakemake.
Merci,
Hassan
Bonjour,
Je me permet de relancer ce sujet. J'ai travaillé jusqu'à maintenant avec la version snakemake/6.14.0, mais il me faut la snakemake/8.0.1 pour d'autres raisons.
Il me semble que je peux pas installer directement openpyxl avec pip ?
Merci,
Hassan
Bonjour @Hassan_Malik ,
snakemake/8.0.1 est déjà installé. Vous pouvez voir la liste des modules snakemake disponibles avec module avail snakemake.
Pour openpyxl, comme vous l'avez dit vous pouvez utiliser les fonctionnalités de gestion d'environment de snakemake : Additional features - Snakemake 8.0.1 documentation
Bonne continuation
1 « J'aime »