Bonjour, Je souhaiterais utiliser proFIA pour retraiter mes données mais ça ne marche pas et j'ai le message d'erreur suivant: "Fatal error: Exit code 1 () Tool generated the following standard error: arguments 'minimized' and 'invisible' are for Windows only Error in unzip(zipfile, list = T) : zip file '/shared/ifbstor1/galaxy/datasets/005/258/dataset_5258006.dat' cannot be opened Execution halted"
J'ai converti mes données acquises avec un LTQ-orbitrap grâce MSconvert, j'ai chargé le dossier zippé avec 7zip sur W4M mais quand je lance proFIA ça ne marche pas. J'ai surement loupé une étape mais je ne vois pas laquelle.
merci beaucoup par avance et bonne journée
En changeant le C12.7zip en C12.zip (une option de 7 zip permet de choisir d'enregister en ZIP), j'arrive a éviter l'erreur de lecture ' Error in unzip(zipfile, list = T) :'
Mais j'ai une nouvelle erreur liée à l'espace mémoire disponible pour l'outil "This job was terminated because it used more memory than it was allocated."
@Lain@tchaussepied vous pourriez augmenter le quota mémoire de l'outil toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/ethevenot/profia/profia/3.1.0 ?
Je profite de la demande d'augmentation de mémoire d'un outil pour informer qu'il y a un autre outil qui aurait besoin de plus de mémoire. J'attendais de finir mes tests pour faire la demande histoire de demander un quota adéquat, mais pour l'heure je sais déjà qu'il faudrait plus de 10GB car sur un autre outil qui fait un calcul similaire et qui est à 10GB, ça ne passe pas même après relance.
Du coup, quitte à ajouter plus de quota à ProFia, si vous pouviez en profiter pour mettre aussi plus de quota à "Between-table correlations" ("corr_table": toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/melpetera/corr_table/corrtable/1.0.0) avec un mem: 12 ou mem: 16 ça fait d'une pierre deux coups (pour info pour l'instant l'outil a l'allocation de mémoire par defaut).
