QIIME2 problème de mémoire

Bonjour,

l'outil qiime2 feature-classifier classify-consensus-vsearch a tourné dans galaxy quelques heures puis a généré une erreur: "This job was terminated because it used more memory than it was allocated."
Le jeu de données utilisé est un jeu de test contenant peu d'échantillons et peu de reads comparé à un vrai jeu de données.

Serait-il possible de résoudre ce problème?
merci et cordialement,
Ségolène

Bonjour @Caboche

j'ai fait un MR pour augmenter les ressources allouées à l'outil. increase qiime2__feature_classifier__classify_consensus_vsearch mem (!708) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / usegalaxy.fr / infrastructure · GitLab
Elle sera bientôt appliquée sur usegalaxy.fr

Thomas

Merci beaucoup pour votre réactivité.
Dans combien de temps pourrais-je tester sur usegalaxy.fr?

Bonjour,

Je pense que demain ce sera disponible.

Bonne journée
Thomas

Bonjour @Caboche

La mise à jour est appliquée.

Bonne journée
Thomas

Bonjour Thomas,

merci beaucoup, je vais tester.

bonne journée,
Ségolène