Qiime2 tools export qui tourne depuis une semaine

Galaxy
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Bonjour,

j'ai lancé un export dans QIIME2 (qiime2 tools export) d'un QZA contenant des séquences (FeatureData[Sequence]) il y a une semaine. Le job est toujours en "running":

Screenshot
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J'ai essayé de le relancer, mais à chaque fois le job reste en "running" sans résultat ni erreur.
Pouvez-vous voir si une erreur est générée dans galaxy?

merci et bonne journée,
Ségolène

2

Bonjour,
Il y a un problème sur ce job en effet, je regarde ça
Anthony

3

Il y avait en effet une dizaine de jobs bloqués : les jobs étaient terminés, mais ils apparaissaient encore en running dans l'historique.
J'ai débloqué manuellement ces jobs, ça devrait être bon maintenant pour cet historique.
Il y a probablement un bug dans le code de galaxy, une issue est ouverte ici à ce sujet : The job finishes correctly, but Galaxy still shows it running. · Issue #13868 · galaxyproject/galaxy · GitHub
Bonne journé
Anthony

4

Bonjour,

avez-vous des nouvelles pour ce bug dans galaxy?
Les jobs que vous avez débloqués manuellement sont verts mais si on relance, ils restent en "running".
Bonne journée,
Ségolène

5

Bonjour,
Ok, j'ai débloqué les jobs en attente. Je ne comprends pas trop pourquoi ces jobs finissent dans cet état. Ça arrive à chaque fois ou pour certains seulement ?
J'espère que la prochaine mise à jour de galaxy résolve le problème, mais sans garantie

6

Bonjour,

merci pour votre réponse.
C'est systématique sur ce genre de jobs (export des données dans QIIME2).
bonne journée