Bonjour,
Nos jobs qui utilisent la librairie R "dada2" (version 1.14.0 via "module load bioconductor-dada2") se terminent fréquemment en "caught segfault, address 0x18, cause 'memory not mapped' srun: error: cpu-node-28: task 0: Segmentation fault (core dumped)".
Il semble que ce soit lié à un bug connu qui a été corrigé dans le version 1.14.1, serait-il possible de passer le module à cette version ?
Merci infiniment !
Pascal
Bonjour,
Il y'a une version + recente de bioconductor-dada2 dans l'environement R 4.0.2
module load r/4.0.2
R
> packageVersion("dada2")
[1] ‘1.18.0’
Est-ce que cette version vous convient ?
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Bonjour et merci pour cette info ultra rapide : je confirme que ça marche du tonnerre avec la version 1.18.0 !
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