@team.r, Installation chAMP R package

IFB Core Cluster Demande de logiciel ou de banque de données
1

Bonjour,

Serait-il possible d'installer le package R "ChAMP" : http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/ChAMP.html et UpsetR : https://cran.r-project.org/package=UpSetR?
Je vous remercie par avance,

Guillaume

2

Bonjour,

L'installation est en cours:

3

Merci beaucoup !

4

Sauf erreur de ma part, le package installé est ChAMPdata et non ChAMP (https://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/ChAMP.html). Serait-il possible d'installer ce package SVP?
Merci par avance,

Guillaume

5

Bonjour,

En effet, l'installation c'est mal passé, je la relance

6

@gvelasco: a priori c'est bon maintenant, pouvez ré-essayer SVP ?

image

7

C'est tout bon! encore merci!

8

Bonjour,

Je souhaiterai importer dans mon espace RStudio de gros fichiers à analyser (>1GB). J'ai essayé plusieurs fois sans succès (message d'erreur). Comment puis-je faire ? Il s'agit des raw data à analyser par ChAMP.
Merci par avance pour votre aide

Guillaume

9

Bonjour,

Vous pouvez les copier dans votre espace projet avec des outils comme filezilla.
Et votre espace projet est normalement accessible depuis rstudio.

Voiri ici pour plus d'info sur le transfert de fichier: