Update eggnog-mapper

IFB Core Cluster
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Bonjour,

Pouvez-vous mettre à jour eggnog-mapper svp ?

merci

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Bonjour @emendes,

La version 2.1.12 d'eggnog-mapper est maintenant disponible avec module load eggnog-mapper/2.1.12

Bonnes analyses :slight_smile:

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Merci.

Avez-vous téléchargé la DB novel_fams ? j'ai cette erreur:

e[31mDIAMOND database /shared/ifbstor1/software/miniconda/envs/eggnog-mapper-2.1.12/lib/python3.12/site-packages/data/novel_fams.dmnd not present. Use download_eggnog_database.py to fetch ite[0m

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Bonjour,

Petite relance concernant la mise à jour de la DB ( novel_fams )

Merci d'avance,

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Bonjour,

J'obtiens également cette erreur lorsque j'essaie de télécharger les bases de données:

Traceback (most recent call last):
  File "/shared/ifbstor1/software/miniconda/envs/eggnog-mapper-2.1.12/bin/download_eggnog_data.py", line 349, in <module>
    download_hmm_database(args.hmmer_dbs, dbname, dbspath)
  File "/shared/ifbstor1/software/miniconda/envs/eggnog-mapper-2.1.12/bin/download_eggnog_data.py", line 125, in download_hmm_database
    os.makedirs(dbpath)
  File "<frozen os>", line 215, in makedirs
  File "<frozen os>", line 215, in makedirs
  File "<frozen os>", line 225, in makedirs
PermissionError: [Errno 13] Permission denied: '/shared/ifbstor1/software/miniconda/envs/eggnog-mapper-2.1.12/lib/python3.12/site-packages/data'