Bonjour,
Serait-il possible d'avoir accès à la partition gpu pour notre projet ?
user : tblevins
project : alphafold2_rna_polymerases
Merci beaucoup d'avance !
Todd
Bonjour,
C'est fait. Pensez bien à spécifier la partition (--partition=gpu), votre compte (--account=<votre-projet>) et à vérifier le bon usage des ressources (https://ifb-elixirfr.gitlab.io/cluster/doc/troubleshooting/#slurm-how-to-use-resources-wisely).
Bonne journée
Bonjour,
Merci beaucoup pour l'accès aux nœuds GPU. L'infrastructure IFB et les logiciels disponibles fonctionnent très bien pour nos premières analyses.
J'aimerais tester des outils alternatifs à AlphaFold2, tels que RoseTTAFold. Cela nécessitera de l'espace pour des bases de données supplémentaires dans le répertoire de mon projet. Serait-il possible d'augmenter le volume du projet, pour le faire passer de 250Go à 1To, s'il vous plaît ?
Je vous informerai à l'avenir lorsque nous n'aurons plus besoin de stockage supplémentaire.
bonne journée
Todd
Bonjour Todd,
C'est fait.
N'hésitez pas à nous faire des retours sur RoseTTAFold ou autre !
Je suis sûr que cela intéressera du monde.
Bonne journée
Merci David,
Je suis impressionné par le support + tutorials (i.e., AlphaFold2 - IFB Core Cluster Documentation) dont vous avez déjà pour AF2 et MassiveFold. Je vous ferai part de notre expérience avec RoseTTAFold (et les outils dérivés) une fois que nous aurons des résultats.
bon week-end,
Todd
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