Cela devrait être bon pour FROGS_clusters_stat @AnnieLebreton
Quel est le message d'erreur ?
pareil : "This job was terminated because it used more memory than it was allocated."
et dans le débugg " An error occurred while running the tool toolshed.g2.bx.psu.edu/repos/frogs/frogs/FROGS_clusters_stat/3.2.3+galaxy2."
Salut @AnnieLebreton
J'ai à nouveau augmenté la mémoire pour l'outil... : increase again mem for FROGS_clusters_stat (!457) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / usegalaxy.fr / infrastructure · GitLab
J'espère que ça va aller cette fois 
Bonjour @lgueguen,
ça ne fonctionne toujours pas (même erreur) mais j'ai pu trouver l'info que je cherchais dans les autres rapports d'outils donc je ne pense pas que ça vaille le coup de passer trop de temps dessus.
Bonne année !
Bonne année à toi également !
J'ai tenté une nouvelle augmentation de la mémoire : Again increase mem for frogs clusters_stat (!461) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / usegalaxy.fr / infrastructure · GitLab
Est-ce que tu pourrais relancer pour vérifier si cela résout le pb, stp ?
Merci!
Loraine
Bonjour Loraine,
Eh non, ça ne marche toujours pas... Il a l'air sacrément gourmand en mémoire cet outil !
Annie
mmm...
Pourrais-tu me copier-coller les "job metrics" du dataset, à la fin de la fenêtre qui s'affiche quand tu cliques sur l'icone "i" en bas du dataset, stp ?
C'est l'outil clustering swarm ou clusters stat qui plante ? Les jobs metrics envoyés correspondent au 1er, alors que j'ai modifié la mémoire pour le 2e.
C'est le cluster stat qui plante mais je n'ai pas de jobs metrics sur le résultat du cluster stat qui plante
Il semble que les 2 dernières augmentation de mem de clusters stat n'avaient pas été prises en compte... Tu pourrais relancer maintenant stp ?
merci pour tes retours !
Loraine
ça fonctionne !!!
Merci
1 « J'aime »
Bonjour
Je viens de relancer FROGS sur un autre jeu de données (5G reads au départ), j'ai de nouveau le message d'erreur
"This job was terminated because it used more memory than it was allocated" cette fois ci pour FROGS Clustering swarm est-ce qu'on peut monter la mémoire max allouée ? Si on veut faire un test de charge j'ai un autre jeu de données à 6.3G dont je n'aurais l'usage qu'à partir de cet été 
(Est-ce que je fais un nouveau sujet ?)
Bonne journée,
Annie
Cela devrait être bon (increase mem for FROGS Clustering swarm (!469) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / usegalaxy.fr / infrastructure · GitLab)
C'est bon, ça fonctionne
Bonjour,
J'ai de nouveau le soucis " job was terminated because it used more memory than it was allocated" pour FROGS Clustering swarm (sur un autre jeu de données)
Est-ce qu'il serait possible d'augmenter la mémoire allouée ?
Merci,
Annie
Bonjour Annie,
C'est en cours : increase mem for FROGS_clustering (!546) · Merge requests · Institut Français de Bioinformatique / usegalaxy.fr / infrastructure · GitLab
Bonne journée,
Loraine