Bonjour,
Serait-il possible d'installer Guppy ?
C'est l'application d'Oxford Nanopore qui permet de décoder les fast5 (signaux électriques) en séquences de nucléotides (fastQ).
Les liens pour l'installation sont sur le site de la communauté Nanopore (Log in - Oxford Nanopore Technologies). La version qui utilise les GPU est supposément la plus rapide.
Je me tiens à disposition si nécessaire,
Cdlt,
Fred Chaux
Bonjour,
Guppy étant sous licence et seulement accessible via une authentification pour télécharger les sources, cela va demander un peu de travail pour générer une image singularity.
Nous allons attaquer ça au plus vite.
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Hop:
$ module avail guppy
------------------------------- /shared/software/modulefiles -------------------------------
guppy/6.1.1-cpu guppy/6.1.1-gpu
Merci beaucoup !
Bonne journee a vous,
Cdlt,
Frederic Chaux
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